近期國內確診個案數雖略有下降，惟每日確診人數仍破百，國人仍不能掉以輕心。為盡快找出潛在的社區感染者，藥師公會全聯會於5月建議指揮中心，應可結合旅遊史(T)、職業別(O)、接觸史(C)、群聚與否(C)及特殊藥品購買紀錄，將藥局納入疑似個案通報機制中。指揮中心也在5月5日的記者會上，公開接受此項建議。6月10日，指揮中心也正式函請全聯會協請藥局「協助衛教並轉介有症狀民眾前往社區指定院所就醫或社區採檢站採檢」，並請轉知會員並請協助。如藥局於執業時發現民眾有疑似COVID-19症狀，轉介後經指定社區採檢院所或社區採檢站通報確診者，並發給個案轉介藥局轉檢獎勵。全聯會也於第一時間轉知各地方公會，並協助完成各縣市通報系統（相關公告：https://reurl.cc/Akdaz3），戮力協助抗疫及確保藥師權益。
不少藥師夥伴們反映，藥師從投入口罩實名制起，陸續協助提供防疫物資、分攤醫療院所無力負擔之調劑需求、強化遠距醫療成效、通報疑似個案及協助疫苗預約接種工作等，在防疫工作上功不可沒。其中藥師助理絕對是不可或缺的角色，應替藥助爭取儘快接種疫苗。對此全聯會十分認同，也始終全力爭取。6月已在媒體上公開呼籲（https://talk.ltn.com.tw/article/paper/1454281），亦已正式行文指揮中心，指出醫事機構工作人員所承擔的風險及所發揮的防疫效果，本質上與醫療機構相同。且若藥助確診，健保藥局所能提供之服務量能將會大幅縮減，嚴重影響防疫工作。
全聯會建請指揮中心審酌現有COVID-19疫苗接種順位之妥適性，將醫事機構之從業人員比照醫療機構，納為第一優先接種順位。亦表明即便認為不適合逕將藥助列為第一類優先人員，至少得明確揭示藥助是屬於哪一類優先接種對象，以解決目前各地方縣市見解不一的問題。目前已知悉金門縣及基隆市政府並不認為藥助為一至五類優先接種對象，而台中市政府則認為藥助屬第五類中所稱之「其他機構工作人員」。
文末再次呼籲公部門正視這樣的問題，目前疫苗數雖非可稱充裕，但既然均已開放高齡長者施打，排除一線抗疫的醫事機構工作者，毫無道理，更會讓長期一起打拚的藥助感到沮喪。
↑指揮中心於6月10日正式函請藥局「協助衛教並轉介有症狀民眾前往社區指定院所就醫或社區採檢站採檢」。