衛生福利部於6月19日公告《民眾使用COVID-19家用快篩試劑檢驗指引》，指出為因應國內近期持續出現本土COVID-19及感染源不明的確診病例，開放民眾居家自我篩檢，以迅速找出疑似陽性個案，阻斷感染源。並載明民眾可至醫療器材販賣業者(如藥粧店、醫療器材行、便利商店等)或藥局購買家用快篩試劑。更於6月23日，各大通路正式開始販售快篩試劑。
藥師公會全聯會認為此舉確能減少社區感染黑數，亦與本會於五月初向指揮中心提出的建議部分相符。惟指引中的居家快篩通報及追蹤流程，過於樂觀，開放部分無醫事人員常駐通路販售快篩試劑，同時僅希望民眾「自行」依身分別進行通報。缺乏追蹤與使用指導，恐導致偽陰性者帶來的風險遽增，對此本會表示憂心。
食藥署於6月21日亦赴本會，針對快篩相關政策進行討論，出席者包含：本會理事長黃金舜、副秘書長邱建強(視訊)、李懿軒、社區藥局委員會主委邱議權、食藥署藥粧組長杜培文、簡任技正林欣慧、科長吳正寧等。
黃金舜指出，指揮中心未採納全聯會有關快篩實名制的建議，卻逕將3,000餘家有意願協助疫苗預約接種的社區藥局，列入可提供諮詢服務列表中，引起基層藥師反彈。全聯會從頭到尾支持的都是「有條件快篩」，目前所有藥商均可販售，但諮詢責任卻僅放在藥局上，這是藥師無法接受的。希望政府至少要釐清：(1)是否符合某些條件，如：防護裝備要求或接觸時間長度，即使販售快篩試劑的通路商接觸到確診者，也可以免被匡列隔離。(2)是否有能力追蹤快篩試劑流向，以減少偽陰性風險。(3)是否有更方便的快篩產品使用說明，如：將廠商製作的教學影片網址製成QRCode廣宣於社區藥局，減少藥局風險與負擔。
邱建強表示，食藥署應對外說明清楚，諮詢藥局名單如何產生及相關權利義務，以化解藥局的誤會。李懿軒則說明，若指揮中心認為家用快篩試劑需要專業醫事人員協助，則不該開放所有藥商均可販賣。後續追蹤通報流程屬必要，民眾配合度不見得高。建議可修改指引文字，如有需要家用快篩試劑，可優先諮詢社區藥局。考量未來可能持續有家用快篩試劑的需求者，屬經濟弱勢或工作性質特殊者，因此建議價格需可負擔。邱議權則補充，藥師絕對有提供諮詢的專業，但若超商買的試劑也來藥局諮詢，會造成困擾。應說明為何家用快篩試劑非屬法定防疫物資，及現況下若有囤積或哄抬價格，有無相關法律工具可處理。若無通報機制，難以在第一時間將確診者從社區中隔離。
杜培文則回應，家用快篩試劑是由指揮中心審酌全局後的決定，希望借重社區藥局專業與可近性，提供一般性的諮詢服務，如：居家篩檢呈陽性後，應如何處理等，而非試劑使用相關問題。
會後全聯會也決議，非由藥局進貨的快篩試劑，藥局如何確定產品的來源、品質與使用方法，若提供不適當的資訊，藥局仍需負責。因此請快篩試劑販售者負起產品衛教、諮詢及售後服務等相關義務與責任，民眾對使用快篩試劑有任何疑問，請洽原購買地點或試劑廠商。
指揮中心會後也回應，跟確診者個案於症狀發生前三天至隔離前有密切接觸（共同用餐、共同生活、未有防護設備下交談15分鐘以上）才須隔離，如雙方做好防護，則不在此範圍內，相關資訊供讀者參考。
↑食藥署醫粧組於6月21日拜訪全聯會，討論「民眾使用COVID-19家用快篩試劑指引」相關事宜。