增設藥學系議題發酵數月，藥師與藥學生甚至走上街頭表達不滿。全聯會除了9月第一時間與立法委員吳思瑤和教育部、衛福部相關機關研議外，11月21日也邀集全國各大藥學院校，一同召開「藥學生員額總量控管相關措施共識溝通會議」。
理事長黃金舜表示，慈濟大學申設藥學系學士班全聯會並不贊同，對於未事先徵詢全聯會意見，全聯會也表達強烈抗議，除慈濟，又傳出中山醫學大學有意新設立藥學系，基層藥師不滿情緒持續擴大。全聯會從未改變過立場，認為政府應依當前藥學生招生總量設立藥學生總額，期盼透過與台灣藥學會及各藥學系召開本次共識會議，進一步溝通交換意見、凝聚共識。
台灣藥學會常務理事沈麗娟發言，慈濟設立藥學系，政府同樣未事先徵詢台灣藥學會之意見，往後期盼政府能更具體說明新設藥學系的整體程序為何。另外，台灣藥學會並不贊同依目前藥學生總量直接設立藥學生總額，應待政府綜合評估社會發展需求、人才培育政策後提出相關分析報告後，再行決定藥學生總額的數量為何。
於本次會議中，詢問各校「是否同意堅守當前藥學生總額，並要求教育部比照醫學生建立規範」，對此各校立場如下：
◆高醫、國防醫、大仁、中國醫、嘉藥：同意依當前藥學生總額，要求教育部比照醫學生建立規範。
◆陽交大、台灣藥學會：同意依照國家整體藥學人才培育政策，及社會發展需求，設立藥學生總額，並要求教育部比照醫學生訂定每年招生總人數。
◆臺大：同意依照國家整體藥學人才培育政策，及社會發展需求，設立藥學生總額，並要求教育部比照醫學生訂定每年招生總人數。針對「堅守當前藥學生總額」則持保留態度。
◆北醫：原則同意藥學生總額，規範需內部相關會議再進一步討論。
此外，亦針對「各校是否同意建立藥學生總額協商平台」與「藥學教育檢核標準內容之意見」二問題進行討論， 本次會議成大與慈濟請假未出席 ，完整會議紀錄可參照全聯會官網公告。
↑藥師公會全聯會於11月21日邀集全國各大藥學院校，一同召開訂定藥學生員額總量控管相關措施之共識溝通會議。